Nel cuore di Pisa sorge l'Orto botanico, luogo di ricerca e di studio, polmone verde della cittą. Ubicato inizialmente nella zona degli Arsenali, il «Giardino dei Semplici» voluto nel 1543 dal medico e botanico Luca Ghini, ha subito vari spostamenti per essere definitivamente collocato nel 1591 dal Granduca Ferdinando I nell'area adiacente a via Santa Maria.
Sede del Dipartimento di Scienze Botaniche dell'Universitą di Pisa, l'Orto e il suo Museo sono stati riaperti al pubblico nel maggio 2005, dopo importanti lavori e sapienti restauri durati quasi tre anni.